基因组大小检测

基因组大小检测


一、检测图形与意义 植物倍性分析 倍性检测服务 倍性分析仪 goldenfcm.cn

样本峰值的荧光强度与细胞DNA含量成正比,利用已知基因组大小的样本(如番茄、小麦等做为对照,根据对照样本和待测样本荧光强度的比例关系计算出待测样本的基因组大小。

对动物、植物基因组大小进行预估,常用于测序过程中的基因组确认和倍性确认。


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此外金迪智远还可进行细胞周期分析:因为荧光强度与细胞DNA含量成正比,根据样本荧光强度的变化可以自动拟合出细胞周期曲线,计算得到G1、S、G2期的细胞比例。用于水稻生长点等材料的细胞周期检测。


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二、已发表项目文章


1. Nature Genetics:高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析(点击链接)

2022年9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆主栽品种“中豌6号”的基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。

该研究中豌豆基因组大小预估由金迪智远生物科技使用德国Sysmex Partec 流式细胞仪(倍性分析仪)完成。


2. Nature Plants : 中国农业大学联合多家单位揭示现代月季起源和育种历史(点击链接)

2024年10月11日,中国农业大学联合康奈尔大学等单位在植物学领域国际著名期刊Nature Plants杂志上发表了题为“Haplotype-resolved genome assembly and resequencing provide insights into the origin and breeding of modern rose”的研究论文。该研究第一次实现了对四倍体现代月季单倍型解析的高质量组装,通过对200多个蔷薇属野生种和月季栽培种的重测序,明确了现代月季(Rosa hybrida)的起源及育种过程。这标志着在现代月季基因组组成、变异以及重要农艺性状遗传解析方面取得了重要突破,为未来现代月季基因组选择育种和分子定向育种提供了坚实的理论基础。

该研究中的倍性检测以及基因组大小分析(基于流式细胞技术),均由金迪智远生物科技完成。所使用的倍性分析仪及倍性检测试剂盒(Cat. 05-5002, CyStain UV Precise P)、基因组大小检测试剂盒(Cat. 05-5022, CyStain PI Absolute P)和Celltrics植物过滤网(Cat. 04-0042-2316)均来自于金迪智远全国代理品牌德国Sysmex Partec。


更多研究案例请查看“项目论文&新闻动态”板块,或点击链接


此处也列出部分已发表论文。植物倍性分析 倍性检测服务 倍性分析仪 goldenfcm.cn


1. 先正达种业:玉米单倍体育种
Kelliher T, Starr D, Richbourg L, et al. MATRILINEAL, a sperm-specific phospholipase, triggers maize haploid induction [J]. Nature, 2017, 542(7639): 105-109.

2. 中国农业大学:苹果基因组
Li W, Chu C, Zhang T, et al. Pan-genome analysis reveals the evolution and diversity of Malus [J]. Nature Genetics, 2025, 57(5): 1274-1286.

3. 中国农业科学研究院作物研究所:豌豆基因组
Yang T, Liu R, Luo Y, et al. Improved pea reference genome and pan-genome highlight genomic features and evolutionary characteristics [J]. Nature Genetics, 2022:1-11.

4. 国家玉米改良中心:单倍体诱导系
Qi X, Liu J, Liu Z, et al. High-throughput haploid induction in bisexual-flower species [J]. Plant Communications, 2022: 100454.

5. 福建农林大学:菖蒲基因组
Ma L, Liu K W, Li Z, et al. Diploid and tetraploid genomes of Acorus and the evolution of monocots [J]. Nature Communications, 2023, 14(1): 3661.

6. 中国农业科学院果树研究所:苹果育种 
Zhang L, Hu J, Han X, et al. A high-quality apple genome assembly reveals the association of a retrotransposon and red fruit colour[J]. Nature communications, 2019, 10(1): 1-13.

其中,2,3,4,5,6为金迪智远直接提供倍性分析服务与技术支持。植物倍性分析 倍性检测服务 倍性分析仪 goldenfcm.cn

三、部分合作单位


华中农业大学
果蔬园艺作物
全国重点实验室

南京农业大学菊花育种实验室

北京大学

现代农业研究院

西北农林科技大学园艺学院国家玉米中心

崖州湾国家实验室

中国水产科学院黄海水产研究所湖南师范大学淡水鱼类国家重点实验室

华中农业大学
水产学院

中国海洋大学

中国科学院
海洋研究所

中国科学院南海
海洋研究所

中国农业大学
园艺学院

中国农科院蔬菜花卉研究所中国农科院作物研究所中国热带农业科学院橡胶研究所华南农业大学亚热带农业国家重点实验室

上海交通大学
农业与生物学院

北京林业大学生物科学学院中国林业科学院中国科学院昆明植物研究所

中国科学院武汉
植物园

中国科学院
植物研究所

中国科学院遗传与发育生物学研究所

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四、送检样本说明与实验周期


1. 适用材料

植物: 叶片、花瓣、花粉、树皮、果实、根系、愈伤组织等;

动物: 新鲜组织,鱼类样本最早可采用发眼卵阶段材料。


2. 材料要求

植物叶片: 单次检测需 0.5cm²(约小拇指甲盖大小),邮寄送检,叶片用量需增至 4 倍以上,预留重复检测用量;

动物肌肉组织: 单次检测取大米粒大小组织即可。


3. 实验周期:从收到样本一周内返回报告。


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五、总结


以上科技服务已广泛应用于林木、农作物、花卉、草类等各种植物,以及鱼类、贝类、螃蟹等水生物和蜱虫、蜂类等昆虫分析,已成功助力科研机构实现大量倍性育种突破,其中包括单倍体水稻、多倍体水稻、单倍体玉米、小麦、月季、杨树、杜仲、柑橘、葡萄、桉树、猕猴桃、苹果、西瓜、梨、虹鳟、泥鳅、鲫鱼、鳇鱼、牡蛎、鲍鱼、半滑舌鳎等三倍体,以及单倍体柑橘,双单倍体番茄、茄子、辣椒等。

测试样本可以是植物叶片、种子、愈伤组织、花粉、花、芽、根等,或是水生物、昆虫的各种组织,您仅需要将新鲜样本邮寄给我们,即可在一周之内得到分析结果。

金迪智远生物所采用的德国Sysmex Partec分析技术,已在国际科学界应用多年,累计发表45100余篇SCI收录论文,包括2017年先正达种业发表在Nature的玉米单倍体育种论文(Kelliher T, Starr D, Richbourg L, et al. MATRILINEAL, a sperm-specific phospholipase, triggers maize haploid induction[J]. Nature, 2017, 542(7639): 105-109.)等,具有广泛的认可度。德国Sysmex Partec在国内的400余家科研用户已发表近百篇SCI收录论文,更多论文可按文末联系方式获取。植物倍性分析 倍性检测服务 倍性分析仪 goldenfcm.cn

六、联系我们

更多信息可扫描二维码添加微信咨询或发邮件至techsupport@goldenfcm.com,欢迎合作!

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金迪智远生物科技十六年致力于倍性分析整体解决方案,包括德国Sysmex Partec倍性分析仪销售与售后, 倍性分析试剂盒与 celltrics 滤网耗材销售,倍性检测服务、基因组大小预估服务、核型分析服务等。以技术与专业为驱动,专注于单倍体育种、多倍体育种及杂交育种,为植物、动物育种科研机构和商业公司提供了超430台装机和37,000+次检测服务。


公司地址:北京市朝阳区朝阳门外大街22号泛利大厦803A室

联系电话:18210982659,15330296769

公众号:动植物流式那些事

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金迪未来生物科技Ploidy Expert也是金迪智远生物科技旗下企业。

公司还可提供各种倍性分析试剂盒,详情扫码咨询植物倍性分析 倍性检测服务 倍性分析仪 goldenfcm.cn

05-5001

CyStain UV Ploidy

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CyStain UV Precise P

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CyStain UV Precise T

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05-5004

CyStain DNA 1 step

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05-5005

CyStain DNA 2 steps

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CyStain PI Absolute P

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CyStain PI OxProtect

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