2022年9月22日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位，成功绘制了中国豌豆主栽品种“中豌6号”的基因组高质量精细物理图谱，构建了栽培和野生豌豆泛基因组，解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构，为揭示豌豆起源驯化，以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。
发表期刊：Nature Genetics
影响因子：41.307
发表时间：2022.9.22
该研究中的流式基因组预估由金迪智远生物科技完成。
ZW6是广泛种植的中国豌豆品种，通过流式细胞术预估的基因组大小为4.28Gb(见补充资料图2和表1)，通过K-mer分析预估的基因组4.26Gb。这两种预估都小于之前文献报道的4.45Gb基因组。通过综合优化PacBio SMRT，10x Genomics，Bionano光学图谱和染色质构象捕获 (Hi-C)以及 Illumina NGS 技术，研究团队完成了高质量、高连续性的染色体水平参考基因组，组装大小为3.79Gb。
基因组大小预估由金迪智远生物科技的德国Sysmex Partec，CyFlow Space型流式细胞仪执行检测，以番茄为参照来预估ZW6豌豆基因组。论文发表的流式检测结果如下：
在基因组测序之前，通过流式细胞术确认样本的染色体倍性和基因组大小可为研究者挑选出合适的测序样本，也可为测序后的基因组组装提供参考。
流式检测工作一定要在测序之前完成，因为二倍体测序明显优于四倍体测序，否则多倍体的基因组组装会因为存在大量重复序列，提高组装难度和工作量，也会拉长项目周期。另外流式还可检测样本的细胞周期是否正常，避免异常的G2期细胞占比过多影响测序准确性。
中国农业科学院作物科学研究所杨涛副研究员和刘荣助理研究员、中国科学院微生物研究所骆迎峰副研究员和胡松年研究员、山东省农业科学院农作物种质资源研究所王栋助理研究员为论文的共同第一 作者。中国农业科学院作物科学研究所宗绪晓研究员、中国科学院微生物所高胜寒特别研究助理、山东省农业科学院农作物种质资源研究所丁汉凤研究员、国际半干旱热带作物研究所和澳大利亚默多克大学Rajeev K Varshney教授为论文的共同通讯作者。
论文链接：
https://doi.org/10.1038/s41588-022-01172-2
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